世界衛(wèi)生組織專家在7月22日就蚊媒傳播疾病基孔肯雅熱發(fā)出警報(bào)，提醒各國做好應(yīng)對準(zhǔn)備，避免疫情大規(guī)模暴發(fā)。基孔肯雅熱多為輕癥，大部分患者可在1—2周之內(nèi)自行恢復(fù)。防范的關(guān)鍵在于防蚊滅蚊、鎖定源頭、控制傳播。
第一時(shí)間確認(rèn)輸入病例來源，能夠支持疾控、海關(guān)等相關(guān)部門快速、精準(zhǔn)、有效地制定防控策略，守護(hù)市民健康。
在此輪基孔肯雅熱疫情中，相關(guān)地區(qū)的疾控中心、海關(guān)緊急響應(yīng)，均使用華大智造(688114)全讀長（SEQALL）系列測序平臺(tái)進(jìn)行基孔肯雅病毒測序，其中華大智造最新款DNBSEQ基因測序儀T1+為多地疾控提供硬核支撐，成功破譯此輪病例樣本基孔肯雅病毒全貌，實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)溯源。
深圳疾控—華大智造聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室基于華大智造T1+基因測序儀，對4例基孔肯雅病毒感染者進(jìn)行測序溯源，其測序覆蓋度均高于99.9%。除深圳疾控之外，T1+助力完成的基孔肯雅病毒溯源報(bào)告在各地疾控陸續(xù)輸出，高效捕獲病毒序列，支持疾控部門快速、精準(zhǔn)、有效地制定防控策略。
作為全球日生產(chǎn)速度最快的桌面式Tb級測序儀，T1+憑借快速、高通量的優(yōu)勢，針對低載量、型別多樣的病毒陽性樣本，無需培養(yǎng)直接進(jìn)行宏基因組測序均可獲得完整全長。T1+也是全球首款可在24小時(shí)內(nèi)產(chǎn)出Tb級別數(shù)據(jù)的桌面式測序儀，具備24小時(shí)Tb級數(shù)據(jù)產(chǎn)出、一鍵自動(dòng)化操作等優(yōu)勢，集成DNB制備與生信分析模塊，實(shí)現(xiàn)“測序—分析一體化”全流程閉環(huán)，可在24小時(shí)內(nèi)一鍵完成DNA文庫的PE150測序任務(wù)，完成SE50測序最多只需7小時(shí)。
T1+針對病原微生物的自動(dòng)化交付全流程方案能夠?yàn)閭魅拘约膊》揽靥峁?qiáng)有力的工具支撐，從樣本提取、文庫制備，再到結(jié)合DNB制備分lane加載系統(tǒng)，最終完成測序并在測序儀內(nèi)自動(dòng)生成生信分析報(bào)告，全程自動(dòng)化解放雙手，可全面滿足公共衛(wèi)生領(lǐng)域?qū)Α熬珳?zhǔn)、快速、簡易”的核心需求。
目前，多地海關(guān)正應(yīng)用CycloneSEQ平臺(tái)開展基孔肯雅病毒全基因組測序，從源頭管控輸入性病例。數(shù)據(jù)顯示，采用CycloneSEQ平臺(tái)G100-ER進(jìn)行測序，其測序結(jié)果覆蓋度可達(dá)100%，與采用DNBSEQ平臺(tái)測序結(jié)果完全一致。憑借納米孔測序技術(shù)實(shí)時(shí)快速的優(yōu)勢，CycloneSEQ測序平臺(tái)可對海關(guān)入境時(shí)在流行態(tài)下的高密度樣本實(shí)現(xiàn)監(jiān)測，高效識(shí)別傳染源，搶占先機(jī)。若傳染源發(fā)生一定程度暴發(fā)，T1+等DNBSEQ測序平臺(tái)則可支持大規(guī)模樣本測序、調(diào)查和溯源監(jiān)測變異。
作為全球首個(gè)、國內(nèi)唯一同時(shí)擁有大規(guī)模商業(yè)量產(chǎn)級短讀長（DNBSEQ）與長讀長（CycloneSEQ）測序產(chǎn)品的企業(yè)，華大智造可為病原微生物的監(jiān)測與防控同時(shí)提供短讀長和長讀長的測序方案，充分滿足不同場景的需求。
