許雅文
世界衛(wèi)生組織專家在7月22日就蚊媒傳播疾病基孔肯雅熱發(fā)出警報(bào),提醒各國(guó)做好應(yīng)對(duì)準(zhǔn)備,避免疫情大規(guī)模暴發(fā)?;卓涎艧岫酁檩p癥,大部分患者可在1—2周之內(nèi)自行恢復(fù)。防范的關(guān)鍵在于防蚊滅蚊、鎖定源頭、控制傳播。
第一時(shí)間確認(rèn)輸入病例來(lái)源,能夠支持疾控、海關(guān)等相關(guān)部門快速、精準(zhǔn)、有效地制定防控策略,守護(hù)市民健康。
在此輪基孔肯雅熱疫情中,相關(guān)地區(qū)的疾控中心、海關(guān)緊急響應(yīng),均使用華大智造(688114)全讀長(zhǎng)(SEQALL)系列測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行基孔肯雅病毒測(cè)序,其中華大智造最新款DNBSEQ基因測(cè)序儀T1+為多地疾控提供硬核支撐,成功破譯此輪病例樣本基孔肯雅病毒全貌,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)溯源。
深圳疾控—華大智造聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室基于華大智造T1+基因測(cè)序儀,對(duì)4例基孔肯雅病毒感染者進(jìn)行測(cè)序溯源,其測(cè)序覆蓋度均高于99.9%。除深圳疾控之外,T1+助力完成的基孔肯雅病毒溯源報(bào)告在各地疾控陸續(xù)輸出,高效捕獲病毒序列,支持疾控部門快速、精準(zhǔn)、有效地制定防控策略。
作為全球日生產(chǎn)速度最快的桌面式Tb級(jí)測(cè)序儀,T1+憑借快速、高通量的優(yōu)勢(shì),針對(duì)低載量、型別多樣的病毒陽(yáng)性樣本,無(wú)需培養(yǎng)直接進(jìn)行宏基因組測(cè)序均可獲得完整全長(zhǎng)。T1+也是全球首款可在24小時(shí)內(nèi)產(chǎn)出Tb級(jí)別數(shù)據(jù)的桌面式測(cè)序儀,具備24小時(shí)Tb級(jí)數(shù)據(jù)產(chǎn)出、一鍵自動(dòng)化操作等優(yōu)勢(shì),集成DNB制備與生信分析模塊,實(shí)現(xiàn)“測(cè)序—分析一體化”全流程閉環(huán),可在24小時(shí)內(nèi)一鍵完成DNA文庫(kù)的PE150測(cè)序任務(wù),完成SE50測(cè)序最多只需7小時(shí)。
T1+針對(duì)病原微生物的自動(dòng)化交付全流程方案能夠?yàn)閭魅拘约膊》揽靥峁?qiáng)有力的工具支撐,從樣本提取、文庫(kù)制備,再到結(jié)合DNB制備分lane加載系統(tǒng),最終完成測(cè)序并在測(cè)序儀內(nèi)自動(dòng)生成生信分析報(bào)告,全程自動(dòng)化解放雙手,可全面滿足公共衛(wèi)生領(lǐng)域?qū)Α熬珳?zhǔn)、快速、簡(jiǎn)易”的核心需求。
目前,多地海關(guān)正應(yīng)用CycloneSEQ平臺(tái)開(kāi)展基孔肯雅病毒全基因組測(cè)序,從源頭管控輸入性病例。數(shù)據(jù)顯示,采用CycloneSEQ平臺(tái)G100-ER進(jìn)行測(cè)序,其測(cè)序結(jié)果覆蓋度可達(dá)100%,與采用DNBSEQ平臺(tái)測(cè)序結(jié)果完全一致。憑借納米孔測(cè)序技術(shù)實(shí)時(shí)快速的優(yōu)勢(shì),CycloneSEQ測(cè)序平臺(tái)可對(duì)海關(guān)入境時(shí)在流行態(tài)下的高密度樣本實(shí)現(xiàn)監(jiān)測(cè),高效識(shí)別傳染源,搶占先機(jī)。若傳染源發(fā)生一定程度暴發(fā),T1+等DNBSEQ測(cè)序平臺(tái)則可支持大規(guī)模樣本測(cè)序、調(diào)查和溯源監(jiān)測(cè)變異。
作為全球首個(gè)、國(guó)內(nèi)唯一同時(shí)擁有大規(guī)模商業(yè)量產(chǎn)級(jí)短讀長(zhǎng)(DNBSEQ)與長(zhǎng)讀長(zhǎng)(CycloneSEQ)測(cè)序產(chǎn)品的企業(yè),華大智造可為病原微生物的監(jiān)測(cè)與防控同時(shí)提供短讀長(zhǎng)和長(zhǎng)讀長(zhǎng)的測(cè)序方案,充分滿足不同場(chǎng)景的需求。
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來(lái)源:紅網(wǎng)
作者:黃宗穎
編輯:蒲思云
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